期刊信息
 

刊名:中国中医药图书情报杂志
曾用名:中国医学文摘·中医
主办:中国中医科学院中医药信息研究所
主管:国家中医药管理局
ISSN:2095-5707
CN:10-1113/R
语言:中文
周期:双月刊
影响因子:0
被引频次:1335
期刊分类:图书情报
期刊热词:
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从生物信息与网络药理角度认识姜黄素治疗膝骨(3)

来源:中国中医药图书情报杂志 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-06-13 06:49

【作者】网站采编

【关键词】

【摘要】图2 | GEO 芯片数据膝骨关节炎差异基因的火山图Figure 2 |Volcanic map of knee osteoarthritis-related differential genes based on GEO chip data图注:红色表示上调基因,绿色

图2 | GEO 芯片数据膝骨关节炎差异基因的火山图Figure 2 |Volcanic map of knee osteoarthritis-related differential genes based on GEO chip data图注:红色表示上调基因,绿色表示下调基因

图3 | GSE 中姜黄素干预差异基因表达热图Figure 3 |Differential gene expression heatmap of curcumin intervention in GSE图注:左边红色表示干预组,黄色表示对照组,中间的红色表示上调基因,绿色表示下调基因

图4 | 药物-疾病共同靶点的韦恩图Figure 4 | Venn diagram of drug-disease common targets图注:Disease 表示膝骨关节炎疾病,Drug 表示姜黄素,两圆共同部分显示129 个共同靶点

表2 |姜黄素治疗膝骨关节炎关键靶点基本信息Table 2 |Basic information on key targets of curcumin in the treatment of knee osteoarthritis

图5 | 药物-疾病共同靶点的PPI 网络图Figure 5 |Protein-protein interaction network diagram of drug-disease common targets图注:菱形节点表示Degree ≥15 的靶点,其他椭圆节点表示Degree<15 的靶点,节点越大,表示该节点在网络中越重要。MAPK3 为丝裂原激活的蛋白激酶3,EGFR 为表皮生长因子受体,ESR1 为雌激素受体1,MDM2 为E3 泛素蛋白连接酶Mdm2,CYP19A1 为芳香酶,MAPK14 为丝裂原激活的蛋白激酶14;AR 为雄激素受体,IGF1R 为胰岛素样生长因子1 受体

图6 | 药物-疾病共同靶点的GO 分析的气泡图(排名前20)Figure 6 |Bubble charts of GO analysis of drug-disease common targets (top 20)

图7 | 药物-疾病共同靶点的KEGG 通路分析的气泡图(排名前20)Figure 7 |Bubble diagram of KEGG pathway analysis of drug-disease common targets (top 20)

图8 | KEGG 通路-白细胞介素17 信号通路Figure 8 |KEGG pathway-interleukin-17 signaling pathway图注:图中的节点(矩形框)代表某一基因(蛋白质),白色节点代表通路蛋白,红色代表姜黄素的关键作用靶蛋白,实线箭头代表激活,虚线箭头代表间接关系,两个箭头中间带圈的表示表达。AP-1 为激活蛋白1,Casp 为胱冬酶;NF-κB 为核因子激活的B 细胞的κ-轻链增强;HSP90 为热休克蛋白90;IKK 激酶包括IKKα,IKKβ,IKKγ;GSK-3β 是一种丝氨酸/苏氨酸激酶;MMP 为基质金属蛋白酶;MAPK 为有丝分裂原活化蛋白激酶

图9 | KEGG 通路-肿瘤坏死因子信号通路Figure 9 |KEGG pathway-tumor necrosis factor signaling pathway图注:图中节点(矩形框)代表某一基因(蛋白质),白色节点代表通路蛋白,红色代表姜黄素的关键作用靶蛋白,实线箭头代表激活,虚线箭头代表间接关系,两个箭头中间带圈的表示表达。CASP3 为胱冬酶3;TNFR1 为肿瘤坏死因子1;AP-1 为激活蛋白1;p38 为MAPK14 别名;MMP 为基质金属蛋白酶;NF-κB 为核因子激活的B 细胞的κ-轻链增强;IKK 激酶包括IKKα,IKKβ,IKKγ;Akt 为一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶;JUN 是1 号染色体的基因;FOS 为一类核蛋白转录因子;NOD2 是位于16 号染色体的基因;Ptgs2:前列腺素内过氧化物合酶2

图10 | 姜黄素-共同靶点-通路网络图Figure 10 |Network diagram of curcumincommon target-pathway图注:黄色的菱形节点表示姜黄素,绿色的椭圆节点表示疾病-中药共同靶点,红色矩形节点表示通路。Curcumin为姜黄素;AKT1 为一种丝氨酸,苏氨酸激酶编码 蛋 白;NFKB1 为B 细胞κ 轻肽基因增强子核因子1;RELA 为网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A;IKBKB 为B细胞κ 轻肽基因增强子抑制因子;CHUK 为螺旋环螺旋结构域扩散激酶;MAPK14 为丝裂原活化蛋白激酶14;JUN 为是禽肉瘤病毒17 的转化基因;EGFR 为表皮生长因子受体;GSK-3β 是一种丝氨酸/苏氨酸激酶

3 讨论 Discussion

膝骨关节炎作为一种常见的慢性、退行性骨关节病,发病率逐年上升,已严重影响人类健康,特别是老年人[26]。目前治疗膝骨关节炎的药物主要以非类固醇类药物消炎镇痛,尚不能根治[27]。骨关节炎属于祖国医学“膝痹”和“鹤膝风”范畴[28],姜黄主治风湿痹痛证,已经被证实治疗膝骨关节炎有效[29],但现有研究关于姜黄素治疗膝骨关节炎的靶点和通路有限,大部分通过前期试验或者查阅文献所得,所以文章旨在应用大数据挖掘,通过网络药理学的方法探讨姜黄素治疗膝骨关节炎的分子作用机制。

图11 | 胰岛素样生长因子1 受体靶点与3D94 蛋白分子对接构象图Figure 11 |Molecular docking image between insulin-like growth factor receptor and 3D94图注:姜黄素化学结构用品红色表示,其他是3D94 靶蛋白结构,胰岛素样生长因子1 受体(IGF1R)在口袋内,S-ASP-1123,M-D94-1,S-MET-1052,M-VAL-1113,M-GLY-1122,M-CYS-1111,H-ASN-1110和M-ARG-1109 都是附近氨基酸残基的名称

文章来源:《中国中医药图书情报杂志》 网址: http://www.zgzyytsqbzz.cn/qikandaodu/2021/0613/733.html

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